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Bioinformática

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Información importante

Tipología Curso
Metodología A distancia
Horas lectivas 300h
Duración 3 Meses
Inicio Fechas a elegir
Bolsa de empleo
  • Curso
  • A distancia
  • 300h
  • Duración:
    3 Meses
  • Inicio:
    Fechas a elegir
  • Bolsa de empleo
Descripción

En el ámbito de la Química es necesario conocer los diferentes campos del análisis biotecnológico, dentro del área profesional del Proceso Químico. Así, con el presente curso se pretende aportar los conocimientos necesarios relacionados con la bioinformática.

Instalaciones (1) y fechas
Dónde se imparte y en qué fechas
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A tener en cuenta

· ¿Cuáles son los objetivos de este curso?

Construir anotaciones elementales para lectura de secuencias de proteínas y ácidos nucleicos.- Relacionar operaciones con diferentes bases de datos, identificando su interoperatividad y comparando registros. - Confeccionar la estructura de archivos y sistemas de archivos de acuerdo a requerimientos previamente establecidos.- Documentar los parámetros utilizados, los resultados obtenidos y en su caso las adaptaciones del sistema.- Identificar los distintos tipos de memoria que componen el ordenador. - Definir el concepto de microchip. - Identificar las características de la memoria caché y los diferentes tipos de memoria que existen. Manejar programas informáticos necesarios para el procesamiento de la información de interés en biotecnología.- Enumerar y describir los sistemas lógicos fundamentales para la búsqueda de datos en biología molecular y de las herramientas de navegación.- Distinguir y realizar las acciones necesarias para reconocer y modificar anotaciones en lenguajes específicos.- Explicar los componentes principales de un ordenador, sus periféricos y soportes lógicos sobre la base de su función y utilidad en biotecnología.- Enumerar y describir los sistemas lógicos fundamentales para la búsqueda de datos en biología molecular y de las herramientas de navegación. - Distinguir y realizar las acciones necesarias para reconocer y modificar anotaciones en lenguajes específicos. - Relacionar operaciones con diferentes bases de datos, identificando su interoperatividad y comparando registros. - Determinar los valores adecuados en la realización de la búsqueda, integrando las herramientas de soporte y los programas de representación gráfica adecuados, y realizando la misma de forma eficiente

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Opiniones

3.0
Valoración del curso
100%
Lo recomiendan
4.1
fantástico
Valoración del Centro

Opiniones sobre este curso

S
Silvia
Opinión verificada
3.0 15/02/2018
Lo mejor: Es flexible y lo puedo hacer en el tiempo que necesito.
A mejorar: Las condiciones en las que me llegó el material pienso que no son las correctas.
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¿Qué aprendes en este curso?

Bioinformática

Temario

"Capítulo 1. INTRODUCCIÓN

Capítulo 2. FUNDAMENTOS BIOLÓGICOS
2.1 Fisiología celular
2.2 Morfología del cromosoma
2.3 Ácidos nucleicos
2.3.1 ADN
2.3.2 ARN
2.3.3 Código genético
2.4 Dogma central de la Biología Molecular
2.5 Regulación génica

Capítulo 3. FORMATOS DE FICHEROS
3.1 Datos en bruto
3.2 FASTA
3.3 FASTAQ
3.4 SAM/BAM
3.5 GFF/GFF3
3.6 GVF
3.7 VCF
3.8 BED

Capítulo 4. BASES DE DATOS GENÓMICAS
4.1 ¿Qué es una base de datos genómica?
4.2 Clasificación de las bases de datos genómicas
4.3 Características de la información genómica
4.4 Construcción de una base de datos genómica
4.5 Modelado de información genómica
4.6 Integración de bases de datos biológicas

Capítulo 5. PRÁCTICA 1: DISEÑO DE BASES DE DATOS BIOLÓGICAS
5.1 Diseño relacional
5.2 Diseño XML

Capítulo 6. PRINCIPALES BASES DE DATOS GENÓMICAS
6.1 GenBank
6.1.1 Formato del registro
6.1.2 Cabecera
6.1.3 Sección de características
6.1.4 Sección ORIGIN
6.2 Refseq
6.3 UniProt
6.4 PDB
6.4.1 Formato del registro
6.4.2 Tipos de registros
6.4.3 Estructura del fichero
6.5 Otras bases de datos genómicas
6.5.1 Bases de datos de secuencias de ADN
6.5.2 Bases de datos de secuencias de ARN
6.5.3 Bases de datos de secuencias de proteínas
6.5.4 Bases de datos de patrones y perfiles
6.5.5 Bases de datos clínico-genéticas
6.5.6 Bases de datos de mutaciones y SNP
6.5.7 Bases de datos de genómica funcional

Capítulo 7. PRÁCTICA 2: BÚSQUEDA DE SECUENCIAS
7.1 Secuencias de organismos procariotas
7.2 Secuencias de organismos eucariotas
7.3 Búsqueda de variaciones
7.4 Ejemplo de estudio de una proteína

Capítulo 8. ANÁLISIS DE SECUENCIAS
8.1 Detección de ORF
8.2 Análisis de calidad
8.3 Alineamiento
8.3.1 Gráficos de puntos
8.3.2 Alineamiento de pares
8.3.3 Alineamiento múltiple
8.3.4 Puntuación del alineamiento
8.4 Identificación de variaciones
8.5 Anotación
8.6 Visualización
8.7 Pipelines analíticos y sistemas de flujo de trabajo

Capítulo 9. PRÁCTICA 3: ANÁLISIS DE SECUENCIAS
9.1 Análisis de la calidad con VecScreen
9.2 Análisis de la composición del ADN
9.2.1 Búsqueda de palabras
9.2.2 Estadísticas de la secuencia con Genomatix
9.2.3 Búsqueda de repeticiones
9.2.4 Búsqueda de ORF
9.3 Alineamiento de secuencias con BLASTN
9.4 Edición de alineamientos
9.4.1 Creación de grupos
9.4.2 Reordenación del alineamiento
9.4.3 Adición y borrado de huecos
9.5 Búsqueda de secuencias homólogas con SIB-BLAST
9.6 Alineamiento múltiple
9.6.1 Alineamiento múltiple con Clustal Omega
9.6.2 Alineamiento múltiple con MUSCLE
9.6.3 Alineamiento múltiple con T-Coffee

Capítulo 10. PROTEÓMICA
10.1 Generalidades
10.2 Estructura de las proteínas
10.3 Métodos de predicción
10.4 Modelado por homología
10.5 Reconocimiento de pliegues

Capítulo 11. PRÁCTICA 4: ANÁLISIS DE PROTEÍNAS
11.1 Análisis BLAST
11.2 Búsqueda de dominios funcionales
11.2.1 Búsqueda de dominios con EBI-Interpro
11.2.2 Búsqueda de dominios con PFAM
11.3 Predicción de la ubicación subcelular
11.4 Búsqueda de estructuras de referencia
11.5 Búsqueda de motivos
11.6 Análisis de la estructura primaria de una proteína
11.6.1 Traducción del ADN en secuencia proteica
11.6.2 Predicción de las propiedades físico-químicas
11.7 Predicción de la estructura secundaria
11.8 Predicción de la estructura terciaria
11.9 Predicción de genes con GENSCAN"

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