Bioinformática aplicada al desarrollo de medicamentos

1. INTRODUCCIÓN A LA BIOINFORMÁTICA.
1.1. Intentando definir la bioinformática.
1.2. Relevancia actual de la bioinformática.
1.3. Formatos de ficheros y bases de datos.
1.4. Proveedores institucionales de datos.
1.5. Herramientas locales y de internet.



2. HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES.
2.1. Sistemas operativos alternativos: introducción a Unix/Linux.
2.2. Órdenes en línea de comandos y filosofía de órdenes encadenadas (pipes).
2.3. Lenguajes de programación: Perl como ejemplo.
2.4. Estructuras de datos, entrada/salida y funciones en Perl.
2.5. Herramientas estadísticas: R como ejemplo.
2.6. Librerías específicas de bioinformática: Bioconductor como ejemplo.
2.7. Gestores de bases de datos: SQL como ejemplo.
2.8. Detrás de las páginas web: HTML, Formularios, CGI, PHP, gestores de contenidos.



3. ALGORITMOS.
3.1. Búsqueda de patrones en secuencias.
3.2. Alineamiento de secuencias: Dotplots y programación dinámica.
3.3. Algoritmos heurísticos: FastA, BLAST y Clustal.



4. BIOINFORMÁTICA APLICADA.
4.1. Análisis de secuencias genómicas (FastA y BLAST).
4.2. Más allá de BLAST: Prosite (búsqueda de patrones).
4.3. Transcriptómica (microarrays y qRT-PCR).
4.4. Minería en datos masivos (high throughput screening).
4.5. Biología de sistemas: Gene Ontology database (GO).
4.6. Análisis de la variación (polimorfismos).
4.7. Análisis de las relaciones evolutivas (filogenias).
4.8. Biología estructural tridimensional: PDB.